NGS Core Facility

  • 전자동 유액 기반 분획 라벨링 장치 (Automated massive droplet based partitioning and labeling system)
    • 모델명

      Chromium

    • 제작사

      10x genomics

    • 용도
      • single cell 수준에서 세포의 barcode tagging 및 partitioning 하여 NGS library 제작에 활용
      • 다양한 application 적용
        • 1) single cell gene expression : 단일세포유전자 발현 분석으로 cell population, cell type, cell states 분석
        • 2) single cell immune profiling : 마우스 또는 인간의 수만개의 T cell, B cell로부터 면역반응과 레퍼토리를 분석,
          feature barcoding 기술을 적용해 cell surface protein과 항원특이성을 분석
        • 3) single cell ATAC : single nuclei sample을 가지고 chromatin campaction과 DNA 결합 단백질의 유전자 발현을 분석,
          open chromatin region을 detect하여 chromatin profiling 정보 분석
      • 세포 특성 분석 및 유전자 발현 프로파일링에 적용
    • 기본사양
      • 100개~최대 8만개 이상, 최대 8개 샘플의 single cell barcode tagging
      • 20분 이내 running time
      • cell capture rate up to 65%
      • 1,000 cells중 0.9% 이하 low rate 분석 가능
      • microfludics 기반
      • 0.09m^2의 small footprint instrument
    • KARA 장비 번호 :

      [의과학-39]

    • 담당자 :

      김지예

    • 메일 :

      jiye@kaist.ac.kr

    장비위치 :

    고성능집적시스템연구센터(N26) 3층 322호

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