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보유장비

NGS Core Facility

Automated massive droplet based partitioning and labeling system 전자동 유액 기반 분획 라벨링 장치

용도

  • single cell 수준에서 세포의 barcode tagging 및 partitioning 하여 NGS library 제작에 활용
  • 다양한 application 적용
  • 1) single cell gene expression : 단일세포유전자 발현 분석으로 cell population, cell type, cell states 분석
  • 2) single cell immune profiling : 마우스 또는 인간의 수만개의 T cell, B cell로부터 면역반응과 레퍼토리를 분석, feature barcoding 기술을 적용해 cell surface protein과 항원특이성을 분석
  • 3) single cell ATAC : single nuclei sample을 가지고 chromatin campaction과 DNA 결합 단백질의 유전자 발현을 분석, open chromatin region을 detect하여 chromatin profiling 정보 분석
  • 세포 특성 분석 및 유전자 발현 프로파일링에 적용

기본사양

  • 100개~최대 8만개 이상, 최대 8개 샘플의 single cell barcode tagging
  • 20분 이내 running time
  • cell capture rate up to 65%
  • 1,000 cells중 0.9% 이하 low rate 분석 가능
  • microfludics 기반
  • 0.09m^2의 small footprint instrument
KARA 장비 번호 [의과학-39]
장비위치 고성능집적시스템연구센터(N26) 3층 322호
담당자 김지예
이메일 jiye@kaist.ac.kr