보유장비
NGS Core Facility
Automated massive droplet based partitioning and labeling system
전자동 유액 기반 분획 라벨링 장치
용도
- single cell 수준에서 세포의 barcode tagging 및 partitioning 하여 NGS library 제작에 활용
- 다양한 application 적용
- 1) single cell gene expression : 단일세포유전자 발현 분석으로 cell population, cell type, cell states 분석
- 2) single cell immune profiling : 마우스 또는 인간의 수만개의 T cell, B cell로부터 면역반응과 레퍼토리를 분석, feature barcoding 기술을 적용해 cell surface protein과 항원특이성을 분석
- 3) single cell ATAC : single nuclei sample을 가지고 chromatin campaction과 DNA 결합 단백질의 유전자 발현을 분석, open chromatin region을 detect하여 chromatin profiling 정보 분석
- 세포 특성 분석 및 유전자 발현 프로파일링에 적용
기본사양
- 100개~최대 8만개 이상, 최대 8개 샘플의 single cell barcode tagging
- 20분 이내 running time
- cell capture rate up to 65%
- 1,000 cells중 0.9% 이하 low rate 분석 가능
- microfludics 기반
- 0.09m^2의 small footprint instrument
| KARA 장비 번호 | [의과학-39] |
|---|---|
| 장비위치 | 고성능집적시스템연구센터(N26) 3층 322호 |
| 담당자 | 김지예 |
| 이메일 | jiye@kaist.ac.kr |